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Open Science Week 2024

Open Science Week 2024 : l'Université Paris-Saclay s’engage pour la Science Ouverte !

Date : du 4 au 8 novembre 2024 

L’Open Access Week est un événement international visant à promouvoir l’accès aux  résultats de la recherche. L’Université Paris-Saclay s’inscrit dans cette dynamique en organisant cette année encore son Open Science Week, du 4 au 8 novembre 2024.

L’évènement, proposé principalement en ligne, sera l’occasion de revenir sur les bonnes pratiques et les défis disciplinaires dans les domaines tels que les sciences humaines et sociales, géosciences/environnement, les sciences du vivant, la santé…

 

Public cible : enseignants-chercheurs, doctorants, post-doctorants, étudiants en masters, personnel d'appui à la recherche, etc.

 

Au programme : webinaires, conférences, tables rondes, stands, etc. 

 

Lundi 4 novembre (SHS) 

10h-11h, Nathalie Delame, Projet Agrilogue : un catalogue de données sur l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Français)

Pour aider les économistes de l’INRAE à accéder aux données les plus couramment utilisées dans leurs travaux, un outil a été mis en ligne sur internet : Agrilogue. L’exposé propose une présentation du contenu actuel et des développements en cours et à venir. 

 

 

11h30 à 12h30, Sébastien Oliveau et Margaux NGUYEN NGOC MINHL’ouverture des données en SHS : un écosystème bien organisé pour accompagner les chercheurs (Français) 


 

14h-15h, Célian Godefroid, Publications scientifiques et données de la recherche en SHS : aspects juridiques (Français) 

Ce webinaire va présenter ce que la loi permet aux chercheuses et chercheurs de faire en termes de publications scientifiques et de gestion des données de la recherche, avec un point sur le cadre légal autour de la science ouverte, son évolution, sa mise en place, et sa pertinence pour les SHS. 

 

15h30-16h30, Caroline Moine, Projet ACTIVATE (Français)

Le projet ACTIVATE (the ACtivist, the archivist and the researcher: novel collaborative strategies of Transnational research, archIVing and exhibiting sociAl and poliTical dissent in Europe,19th-21st centuries), est un projet Marie Curie Staff Exchanges, qui repose sur le financement de mobilités. Durant 4 ans (2025-2028) il souhaite permettre de définir le rôle et l’importance de collecter, archiver, valoriser et diffuser des documents, objets et données afin de contribuer à écrire une histoire renouvelée de l’engagement politique et social dans l’Europe des XIXe, XXe et XXIe. Le consortium est formé de 16 partenaires (universités, archives et musées), de 7 pays différents. Parmi les objectifs fixés : des publications académiques, des expositions, des écoles d’été mais aussi la production de podcasts et de Ressources éducatives libres concernant la formation en archivistique. De fait, ACTIVATE pose différents enjeux et défis de science ouverte, dans un cadre européen.

 

Mardi 5 novembre (Sciences et techniques) 

10h-11h, Sylvain Chevallier, Open science tools for reproducibility (English)  

11h30-12h30, Julien Chiquet, Projet revue Computo (Français)

Computo est une revue en open access qui est gratuite pour les lecteurs et les auteurs. Elle met en avant les contributions algorithmiques et computationel dans les statistiques et le machine mearning.

 

14h-15h, F. Massimo (lauréat du prix science ouverte du logiciel libre de recherche 2023), Smilei (Open source plasma simulation software):ecosystem and perspectives of a collaborative, multi-purposeParticle in Cell code. (English) 

Smilei is a collaborative, open-source Particle-in-Cell (PIC) simulation code, recognized in plasma physics for its diverse range of applications, including high intensity laser-matter interaction, astrophysics, fusion and plasma acceleration, as well as for its user-friendly interface. 

 

The talk will trace the history of the code, describing its main developments by a team of experts in laser-plasma interaction and high-performance computing. It will highlight the evolution of its thriving community, which has gradually expanded to the international level, allowing the code to become a platform for physics research, advancements in parallel computing techniques, and educational programs in plasma physics at universities.

The talk will also address examples of challenges underlying the development of an open-source, high-performance, user-oriented simulation code and discuss the future perspectives of Smilei in its ecosystem.

 

16h-17h, J. Peloton (lauréat du prix science ouverte du logiciel libre de recherche 2023), FINK-Logiciel Libre : « Explorer l'univers ensemble : La science ouverte et son rôle dans la recherche en astronomie » (Français)

Dans un monde de plus en plus interconnecté, la science ouverte émerge comme un catalyseur essentiel pour l'avancement de la recherche en astronomie. Cette intervention explore comment la collaboration et le partage des logiciels et des données entre scientifiques, institutions et le grand public peuvent enrichir notre compréhension de l'univers. En mettant en lumière des initiatives de science participative et une plateforme de données ouvertes à travers le projet en astronomie Fink, nous examinerons les avantages de l'accessibilité et de la transparence dans la recherche astronomique. Enfin, nous discuterons des défis et des opportunités que présente la science ouverte en matière d'informatisation de la société.

 

Mercredi 6 novembre (multidisciplinaire) 

10h-11h30, Science ouverte et sport : table ronde animée par Arnaud Boutin, en présentiel (places limitées), (retransmis simultanément en visioconférence) : « Approche multidisciplinaire de la Science Ouverte en sciences du sport et du mouvement humain » 

Lieu : Salle des actes au bâtiment 335, Faculté des Sciences du Sport – Université Paris-Saclay, Rue Pierre de Coubertin, 91440, Bures-sur-Yvette.  

Cette table ronde réunira des enseignant.e.s-chercheur.euse.s de divers domaines scientifiques (neurosciences, management, sciences sociales...) pour aborder les enjeux et défis liés à la science ouverte dans la recherche en sciences du sport et du mouvement humain. 

Les intervenants : 

- Claire Thomas-Junius (Professeure, Université d'Evry) 

- Matthieu Guemann (Maître de Conférences, Université d'Orléans) 

- Bastien Berret (Professeur, Université Paris-Saclay) 

- Christophe Granger (Maître de Conférences, Université Paris-Saclay) 

- Antoine Feuillet (Maître de Conférences, Université Paris-Saclay) 

- Arnaud Boutin (Maître de Conférences, Université Paris-Saclay) - En charge de l'animation. 

 

14h-15h, Liliana Ibanescu, projet DataSusFood,Structurer et ouvrir les données pour améliorer la durabilité des systèmes alimentaires. (Français) 

(Projet lauréat du prix national de la science ouverte du MESR catégorie 'créer les conditions de la réutilisation’ des données alimentaires)

Ce webinaire présentera un écosystème d’outils pour permettre la gestion et le partage des données sur les transformations des matières agricoles en aliments et bioproduits ainsi que sur leurs impacts environnementaux. https://datasusfood.hub.inrae.fr/

 

15h30-16h30, Thomas Guillemaud, Présentation Revue PCI (Peer Community in), (Français) 

 Peer Community Journal est une revue en open access modèle diamant : elle est gratuite pour les auteurs et les lecteurs. Elle est créée et financée par l'association à but non lucratif et non commerciale Peer Community In (PCI).

Jeudi 7 novembre (Gésociences/environnement, sciences du vivant)  

9h30-10h30, Zelia Dionnet, Projet SSHADE (Solid Spectroscopy Hosting Architecture of Databases and Expertise) (English)

 

In this presentation, I will introduce SSHADE, a database infrastructure dedicated to solid state spectroscopy for materials of astrophysical interest. SSHADE provides a vast collection of spectral data (from gamma rays to radio waves) on materials such as ices, minerals, rocks, organic compounds, and evenliquids. These samples come from laboratory syntheses, natural terrestrial analogues, or extra terrestrial sources, including meteorites and lunarsoils. 

 

 

11h-12h, Frederic Schmidt, Projet PDSSP (Pole des Surfaces Planétaire) (Français)  

Le Pôle de Données et Services Surface Planétaire PDSSP est une nouvelle structure entre le CNRS (Institut des Sciences de l’Univers) et le CNES qui a pour vocation de fédérer et coordonner les actions des Services Nationaux d’Observations et de faire émerger des nouveaux services sur la thématique des surfaces planétaires. L’objectif du pôle est de mettre à disposition les données des missions spatiales et au sol, ainsi que de proposer des services de calculs sur ces données. Le pôle s’inscrit dans deux grandes familles de standards internationaux issues des Geosciences avec l'Open Geospatial Consortium (OGC), et de l’Astronomie International Virtual Observatory Alliance (IVOA).

14h-15h, Nicolas Darcel, Sciences Transformatives en Alimentation : Co-construction de Savoirs pour Améliorer la Qualité de l'Alimentation des Enfants - le projet "SPÉCIALE" (Sciences participatives), (Français) 

 

Vendredi 8 novembre (Biologie, Santé, Médicaments)  

10h-11h, Nicolas Boulant, Projet Iseult et partage des données de santé

Edouard Duchesnay, Intelligence Artificielle, Neuroimagerie appliquée à la psychiatrie : l'enjeu de l'accès aux données (Français) 

NeuroSpin au CEA de Saclay s’intéresse à l’exploration du cerveau sain et pathologique. Ici, nous pourrons présenter 2 volets de recherche couvrant le phénotypage de masse, multi-centrique, avec acquisitions standardisées et celui de pointe, moins répandu, rendu possible grâce à l’unique IRM Iseult.

 

11h30-13h, table ronde virtuelle (Français): « L’évaluation et la science ouverte », animée par Patrick Couvreur

Liste des participants : Nicolas Gigant, Sofia Cussoto, Etienne Augé, etc. (à venir)

Des questions seront abordées :  

- Comment réaliser une évaluation objective et de qualité dans le contexte de la science ouverte ? 

- Faut-il proscrire absolument les données bibliométriques dans l'évaluation des chercheurs et des équipes?

- Le chercheur doit-il rester maître du choix de la revue dans laquelle il publie ? Liberté académique ?

- Comment bien choisir la revue dans laquelle publier ?

- Le chercheur doit-il conserver les droits d'auteur ? Ou bien ces droits relèvent-ils de l'institution dont il dépend ?

- Comment homogénéiser les critères d'évaluation au niveau international ?

- En plus des publications ne faut-il pas prendre en compte d'autres critères ? Lesquels ? Etc.  
 

14h-15h, Grégoire Rey, France Cohortes, une infrastructure facilitant la production et le partage des données en épidémiologie (Français) 

France Cohortes est une infrastructure de recherche dédiée aux grandes enquêtes en épidémiologie, et qui vise à faciliter la production, la gestion et le partage des données, en respectant la réglementation, la protection des données, et les principes FAIR. 

 

15h30 - 16h30, Céline Hernandez, FAIR_bioinfo : appliquer les principes FAIR dans un projet de bioinformatique (Français)  

 

Les concepts FAIR (Facile à trouver, Accessible, Interopérable, Réutilisable) ont été initialement définis dans le contexte de l’ouverture des données de la recherche. Mais ces principes peuvent aussi être adaptés dans une certaine mesure à un projet de développement et/ou analyse bioinformatique/biostatistique. Dans ce cadre, des outils existants de suivi de version, d'aide à la reproductibilité ou encore de conteneurisation sont d'une grande aide. Avec cette idée, la formation FAIR_bioinfo a été mise en place à l'échelle nationale par l'Institut Français de Bioinformatique en partenariat avec l'Institut de Biologie Intégrative de la Cellule, afin de propager la connaissance de ces outils et les bonnes pratiques associées. 

 

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